한국연구재단은 학술 및 연구개발활동을 효율적으로 지원하는 것을 그 사명으로 한다. 임직원 모두는 이러한 재단의 설립 취지와 목적을 충실히 구현하고자 재단을 세계 최고의 연구관리전문기관으로 육성하기 위해 지켜야 할 윤리헌장을 제정하고 이를 실천할 것을 다짐한다.

• 하나, 우리는 인간과 자연에 대한 연구자들의 끊임없는 탐구를 촉진하여 인류를 위한 새로운 가치 창출에 기여한다.
• 하나, 우리는 선진화된 연구환경을 조성하기 위하여 공정성과 투명성의 토대 위에서 언제나 연구자 친화적인 자세로 업무를 수행한다.
• 하나, 우리는 연구자의 의견을 존중하며, 국민이 기대하는 우리의 책무를 완수하기 위하여 최선을 다한다.
• 하나, 우리는 지속적인 자기계발을 통해 고도의 전문성을 갖추도록 힘쓰고, 효율적이고 창조적인 업무체계를 구축하며, 조직역량의 향상을 위해 끊임없이 노력한다.
• 하나, 우리는 임직원 개개인의 인격을 존중하고 차별하지 않으며 균등한 기획의 제공과 공정한 평가의 실시로 건전한 조직문화의 형성을 추구한다.
• 하나, 우리는 정직하고 성실하게 직무를 수행하고 권한을 남용하지 않으며, 건전한 사회인으로 품위를 해치는 행위를 하지 않는다.